Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp31E9Q6Y8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp31E9Q6Y8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms