Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup153E9Q3G8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup153E9Q3G8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup153E9Q3G8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nup153E9Q3G8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nup153E9Q3G8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nup153E9Q3G8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nup153E9Q3G8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nup153E9Q3G8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms