Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4f2E9Q366 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f2E9Q366 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f2E9Q366 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms