Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms