Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc171E9Q1U1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc171E9Q1U1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc171E9Q1U1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms