Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Zfp558E9Q1J0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp558E9Q1J0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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