Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1B3

Gm7275, Predicted gene 7275, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7275E9Q1B3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm7275E9Q1B3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm7275E9Q1B3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm7275E9Q1B3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm7275E9Q1B3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm7275E9Q1B3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm7275E9Q1B3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7275E9Q1B3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7275E9Q1B3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm7275E9Q1B3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7275E9Q1B3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7275E9Q1B3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7275E9Q1B3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms