Protein–RNA interactions for Protein: E9Q101

Gm6034, Predicted gene 6034, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6034E9Q101 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm6034E9Q101 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6034E9Q101 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6034E9Q101 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms