Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rsf1E9PWW9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rsf1E9PWW9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rsf1E9PWW9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms