Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30bE9PVL6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30bE9PVL6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms