Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2956E9PVJ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms