Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syde2E9PUP1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syde2E9PUP1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms