Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3bE9PUL3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3bE9PUL3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms