Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zscan18E9PUD6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan18E9PUD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms