Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035044E0CXF8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms