Protein–RNA interactions for Protein: E0CX23

Umad1, MCG2776, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Umad1E0CX23 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Umad1E0CX23 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Umad1E0CX23 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms