Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gm20521D3Z5F7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gm20521D3Z5F7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gm20521D3Z5F7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Gm20521D3Z5F7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms