Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms