Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
9230113P08RikD3YWX3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
9230113P08RikD3YWX3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms