Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb5B5X0E4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcb5B5X0E4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms