Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syce3B5KM66 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms