Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11cB4XVP9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11cB4XVP9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms