Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Polr3aB2RXC6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Polr3aB2RXC6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr3aB2RXC6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms