Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap58B2RW38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms