Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518bB2RRE4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms