Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1B2KF50 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1B2KF50 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms