Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtpruB1AUH1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PtpruB1AUH1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtpruB1AUH1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
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