Protein–RNA interactions for Protein: B1ASQ7

Gm13212, Predicted gene 13212, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13212B1ASQ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm13212B1ASQ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm13212B1ASQ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm13212B1ASQ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm13212B1ASQ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm13212B1ASQ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm13212B1ASQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm13212B1ASQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm13212B1ASQ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm13212B1ASQ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13212B1ASQ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13212B1ASQ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms