Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spocd1B1ASB6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spocd1B1ASB6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms