Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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