Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pfkfb3A7UAK5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfkfb3A7UAK5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfkfb3A7UAK5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfkfb3A7UAK5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfkfb3A7UAK5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pfkfb3A7UAK5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pfkfb3A7UAK5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms