Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms