Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll11A4Q9F4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms