Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms