Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf39A2RT81 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf39A2RT81 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms