Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htra4A2RT60 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra4A2RT60 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htra4A2RT60 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htra4A2RT60 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htra4A2RT60 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htra4A2RT60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms