Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ism1A2ATD1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ism1A2ATD1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ism1A2ATD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms