Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef17A2ASJ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms