Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtf1A2AQ19 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtf1A2AQ19 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms