Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms