Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GabreA2AMW3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabreA2AMW3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms