Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Frmpd1A2AKB4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Frmpd1A2AKB4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms