Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm12A2AJ77 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm12A2AJ77 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms