Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmcn2A2AJ76 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmcn2A2AJ76 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmcn2A2AJ76 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hmcn2A2AJ76 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms