Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd4A2AFR3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd4A2AFR3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms