Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700023F06RikA2AB62 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700023F06RikA2AB62 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms