Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87977A2A958 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87977A2A958 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C87977A2A958 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C87977A2A958 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C87977A2A958 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C87977A2A958 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C87977A2A958 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C87977A2A958 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C87977A2A958 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C87977A2A958 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms