Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsg1A2A825 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rsg1A2A825 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsg1A2A825 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms