Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms