Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUH6

Rbm8a2, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm8a2A0A0N4SUH6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms